העוגב הליטורגי של כנסיית יוחנן הקדוש בעין כרם, מקום הולדתו של יוחנן המטביל, שייך ל"קוסטודיה הכללית של ארץ הקודש"של המסדר הפרנציסקאני. העוגב נבנה על ידי בונה העוגבים האוסטרי מאורכר ובניו מזלצבורג ונחנך ב-1893. מספר תיקונים ושיפוצים נעשו בו מאז אך מבלי לפגוע ביופיין המיוחד של רוב המחללות שלו. ב-1955 האח דלפינו טבואדה, בונה העוגבים של המסדר הפרנציסקאני בארץ, הוסיף מחללת של חליל '2 למקלדת הראשונה, וגדעון שמיר ביצע שיפוץ כללי ב-1962. העוגב נמצא בטריבונה הימנית, וכמעט אינו נראה מלמטה. לארגז אין כל קישוט. בחזית מוצבים חלק מחלילי המחללת שליט '8. הקונסולה נמצאת ליד העוגב, דבר הגורם לכך שהנגן שומע את הצלילים עם שנייה אחת של עיכוב. האקוסטיקה של הכנסייה מרשימה למדי ומוסיפה לצלילי העוגב יופי ושלמות. חבל רק שאין בין המחללות צלילי אליקווטים (קווינטות או טרצות) וגם לא לשוניות, להוציא כמובן את החצוצרה '8 שלה צלילים מדהימים. ידוע ממסמכים השמורים במנזר הפרנציסקאני בירושלים שהעוגב היה בכנסייה הזאת לפחות החל מהמאה ה-XVIII . אכן האחים אנטוניו מונטון ופרנציסקו קסיביאך באו ממחוז ולנסיה שבספרד בשנת 1755 על מנת לבנות בירושלים עוגב לכנסייה הזאת. שמו של נגן העוגב דאז הגיע גם הוא אלינו. שמו היה האח פרנציסקו לורגה.

הפוסט עוגב כנסיית יוחנן הקדוש בעין כרם הופיע לראשונה ב-קונצרטים לעוגב | עוגבים | חובבי העוגב בישראל בעמותת אוצר המוסיקה היהודית.